Dari sebuah musholla kecil hingga menjadi Yayasan Pendidikan yang menaungi dua madrasah formal — inilah sejarah dan jati diri Madrasah Nurul Qur'an.
Para tokoh masyarakat dan ulama Desa Bendungrejo telah lama merindukan berdirinya sebuah pesantren. Jauh sebelumnya, di desa ini pernah berdiri pesantren yang dirintis M.K. Jamsari (1880–1919), yang kemudian musnah oleh kebakaran. Semangat itu dihidupkan kembali oleh KH. Marzuki pada 1926, diteruskan Kyai Ahmadun, hingga KH. Imam Munawwar.
Titik balik terjadi ketika M. Qomari Sholeh — cucu KH. Marzuqi dan santri PP. Madrasatul Qur'an Tebuireng — pulang ke Bendungrejo. Pada 12 November 1992 M / 17 Jumadil Ula 1413 H, resmi lahirlah Pondok Pesantren Nurul Qur'an, diawali oleh dua santri pertama dan wakaf tanah dari Abah H. Sholeh Abdulloh.
"Anak-anak yang sudah selesai menghafal Al-Qur'an ini jangan kecil hati, bahkan boleh bangga asal tidak sombong — sebab yang telah diberi Allah hafal Al-Qur'an sama halnya diberi sesuatu yang sangat agung dan mahal harganya."
— KH. Qomari Sholeh, pendiri PP. Nurul Qur'anSepeninggal KH. Qomari Sholeh pada 1999, pesantren diteruskan oleh KH. Drs. Jumali Ruslan, sahabat sekaligus adik iparnya. Di atas fondasi inilah Yayasan Pendidikan PPNQ kemudian mendirikan dua lembaga pendidikan formal: MTs Nurul Qur'an (1998) dan MA Nurul Qur'an (2000).
Pesantren rintisan M.K. Jamsari berkembang, namun musnah terbakar sepeninggal beliau.
KH. Marzuki mendirikan musholla, cikal bakal kembalinya kegiatan mengaji di Bendungrejo.
Musholla berkembang menjadi masjid pada masa Kyai Ahmadun, diresmikan para ulama Jombang.
PP. Nurul Qur'an resmi lahir, dirintis KH. Qomari Sholeh bersama masyarakat Bendungrejo.
MTs Nurul Qur'an berdiri sebagai jenjang pendidikan formal setingkat SMP.
MA Nurul Qur'an berdiri, melanjutkan jenjang pendidikan formal setingkat SMA.
Pesantren diteruskan KH. Drs. Jumali Ruslan bersama Yayasan Pendidikan PPNQ.
MTs dan MA Nurul Qur'an masing-masing memiliki visi misi yang selaras dengan jenjang dan kebutuhan siswanya.
Membentuk manusia yang beriman, berilmu, beramal, dan berakhlaq qur'aniy.
Membentuk manusia yang bertaqwa, berilmu, berakhlaq mulia, unggul dalam prestasi, dan berwawasan kebangsaan.
| NSM | 121235170040 |
| Status | Swasta |
| Kepala Madrasah | Drs. H.A. Basuni Sholeh, M.Pd. |
| Tahun Berdiri | 1998 |
| Alamat | Dsn. Bendungrejo RT 003 RW 013, Jogoroto, Jombang, Jatim 61485 |
| Telepon | 0321 868331 |
| mtsmanurulquran@gmail.com |
| NSM | 131235170042 |
| Status | Swasta |
| Kepala Madrasah | Hj. Nur Maslahah, M.Pd.I |
| Tahun Berdiri | 2000 |
| Alamat | Dsn. Bendungrejo RT 003 RW 013, Jogoroto, Jombang, Jatim 61485 |
| Telepon | 0321 868331 |
| mtsmanurulquran@gmail.com |
Dibina oleh tenaga pendidik dan kependidikan yang berdedikasi, dalam suasana kekeluargaan khas pesantren.
Tersedia asrama bagi siswa dari luar kota maupun luar Jawa untuk bermukim di lingkungan madrasah.
